Não sei exatamente qual o seu problema mas acho que posso ter a solução!!!
Na nova versão do Blender todas as propriedades(Material, texturas, animações,...) que não estiverem atribuidas a um objecto são apagadas no momento que fechas o programa.
E para resolver o problema tens que precionar o botão com a letra "F" em frente desses atributos, o que guarda a propriedade mesmo que ela não esteja aplicada a um objeto.
Note que na figura abaixo, em frente de cada um desses nomes há "0" e "F" e há outros nomes que não tem nada a frente.
- Os que não têm nem "0" nem "F" a frente quer dizer que estão aplicadas a algum objecto;
- Os que tem "0" a frente são apagados ao fechares o BLENDER;
- E os que têm "F" a frente são guardados.
Apesar de eu não ter muita certeza essa é conclusão que tirei!!!